A la demande son ancien chef, le capitaine Tanaka, Danny doit protéger l'unique témoin d'une affaire de meurtre qui remonte à sept ans. Ce dernier serait sur le point de sortir du coma dans lequel il est plongé depuis. Ce serait pour Danny l'occasion de résoudre cette vieille enquête. Il se remémore que pendant la même période, il avait été chargé de travailler sur l'homicide de John McGarrett, ce qui l'avait amené à rencontrer son futur coéquipier.