Alors qu'ils enquêtent sur une affaire d'espionnage qui touche le département de cryptologie du Pentagone, les agents DiNozzo et David se rendent chez une scientifique. Mais ils y découvrent son cadavre, une balle dans la tête. Le NCIS doit déterminer s'il s'agit d'un suicide et surtout si cette spécialiste était la taupe qu'ils recherchaient. Mais grâce aux déductions d'Abby, ils se rendent compte que la victime n'était pas seule chez elle au moment de sa mort.