Le NCIS a pour mission d'escorter le chef des opérations navales, qui a déjà reçu des menaces de mort. McGee donne l'alerte et abat un homme qui se montrait menaçant. Mais il s'avère que celui-ci était un lieutenant de police sous couverture. Aucune arme, ni balles ne sont retrouvées. La directrice Shepard ordonne une enquête sur McGee. Toute l'équipe se serre les coudes et cherche à prouver son innocence.