Lors de l'arrestation d'un marchand d'armes, le NCIS découvre que le système de défense de la Navy est sur le point d'être vendu à l'un des trafiquants les plus recherchés au monde, surnommé la « Grenouille ». Pour les besoins de l'enquête, Ducky est mis à contribution sur le terrain. Il va travailler sous couverture pour approcher l'homme, qui souhaite acheter un logiciel d'espionnage. De son côté, Gibbs apprend que Tony travaille directement pour la directrice Shepard, laquelle semble vouloir se venger personnellement de la « Grenouille »...