L'ordinateur portable du vice-amiral Clifford Chase est la cible d'un virus informatique. Il charge McGee et l'équipe du NCIS de remonter jusqu'au pirate avant qu'il n'efface toutes ses données. Les choses se compliquent quand l'infection se propage aux fichiers de Gibbs et de ses agents. Ces derniers se tournent alors vers un membre du service de lutte contre le cyberterrorisme. Parallèlement, Alex soutient sa mère qui traverse une épreuve.