L'équipe du N.C.I.S navigue en eaux troubles. La directrice Jenny Shepard reste déterminée à faire payer à La Grenouille la mort de son père. Mais de récentes empreintes laissent supposer qu'il serait toujours vivant. Par ailleurs, les agents sont confrontés à la disparition de Tony. Il travaillait sous couverture comme professeur de cinéma. Mais La Grenouille l'a démasqué...