L'équipe est dépêchée sur une scène de crime : un lieutenant de marine a été découvert mort sur son lieu de travail. Il semblerait qu'il ait été tué par Otto, un robot doté d'une intelligence artificielle, au cours d'une expérimentation. En parallèle, DiNozzo continue d'opérer en secret sous les ordres de la directrice et vit une relation harmonieuse avec Jeanne.