L'équipe du NCIS tente encore d'empêcher un conflit global, orchestré par Daesh au Moyen-Orient. Tous les agents en Irak, en Iran, en Israël et en Arabie Saoudite sont mobilisés. Callen et Sam collaborent avec le capitaine de vaisseau Harmon Rabb Jr. pour appréhender les espions à bord de l'USS Allegiance, tandis que Hetty tente de neutraliser une attaque au missile au Moyen-Orient. Dans le même temps, Kensi et Deeks sont, eux, en Irak, dans une unité mobile de la CIA. Mais ils ont pris sous le feu d’une douzaine de soldats de Daesh.